केंद्र सरकार की अधिसूचना के बाद सीबीआई ने हाथरस केस की जांच अपने हाथ में लेली है। हाथरस कांड की जांच गाजियाबाद ब्रांच को सौंपी गयी है। एक दो दिन में सीबीआई की टीम हाथरस जाकर जांच शुरू कर देगी। पीड़ित परिवार की मांग पर सीएम योगी आदित्यनाथ ने सीबीआई जांच के आदेश किए थे। अभी तक इस केस की जांच एसआईटी कर रही थी। एसआईटी को सात अक्टूबर तक रिपोर्ट सौंपनी थी लेकिन कई नई बातें सामने आने के बाद एसआईटी ने 10 दिन का अतिरिक्त समय मांगा था। एसआईटी जांच कर ही रही थी कि इसी बीच सीबीआई जांच का नोटिफिकेशन जारी हो गया। अभी यह निश्चित नहीं है कि सीबीआई जांच के साथ ही क्या एसआईटी जांच जारी रहेगी या एसआईटी अब तक की जांच का ब्योरा सीबीआई को सौंप देगी।
उन्नीस वर्षीया युवती के साथ कथित दुष्कर्म तथा मारपीट के बाद मौत की जांच कर रही एसआईटी ने बुलगड़ी गांव के 40-45 लोगों से इस केस के बारे में पूछताछ की है। डीआईजी (विशेष जांच) शलभ माथुर भी हाथरस जाकर इंतजाम का जायजा ले चुके हैं।
एसआईटी ने घटना के बारे में पूछताछ करने के साथ ही युवती के अंत्येष्टि स्थल का भी दौरा किया। ऐसा बताया जा रहा है कि सुरक्षा के मद्देनजर पीड़ित परिवार को लखनऊ रखा जाएगा। ऐसा इलाहाबाद हाई कोर्ट की लखनऊ बेंच के आदेश के तहत किया जा रहा है जिसमें हाईकोर्ट ने यूपी सरकार से पीड़ित परिवार को समुचित सुरक्षा दिए जाने को कहा था। इस मामले में 12 अक्टूबर को सुनवाई के दौरान प्रदेश के बड़े अधिकारियों के साथ ही पीड़ित परिवार भी अदालत में मौजूद रहेगा।.