भीमा-कोरेगांव प्रकरण में गिरफ्तार किए गये गौतम नवलखा की मंशा बहुत खतरनाक थी। गौतम नवलखा पाकिस्तान की खुफिया एजेंसी आईएसआई के लगातार सम्पर्क में था। गौतम नवलखा ने आईएसआई के चीफ से भी मुलााकात की थी। गौतम नवलखा ने अमेरिका में गिरफ्तार किए गए आईएसआई के एजेंट गुलाम नबी फई की रिहाई के लिए खत लिखा था। गौतम नवलखा और आईएसआई के बीच कोडवर्ड में बातचीत होती थी। वो फोन और ईमेल के जरिए आईएसआई से संपर्क करता था।

ये सारी बातें एनआईए ने अदालत में दाखिल की चार्जशीट में लिखी हैं। कुछ और संगीन आरोप एनआईए ने लगाए हैं।जिनका जिक्र सार्वजनिक नहीं किया जा सकता। एनआईए ने गौतम नवलखा के खिलाफ चार्जशीट में जो आरोप लगाए हैं उनका आश्य है कि गौतम नवलखा शहरों और पढ़े लिखे लोगों का ब्रेनवॉश कर उन्हें सरकार के खिलाफ विद्रोह के खिलाफ तैयार करना था।

ध्यान रहे, महाराष्ट्र के पुणे के पास भीमा-कोरेगांव में एक युद्ध स्मारक के पास एक जनवरी 2018 को हिंसा भड़क गई थी। पुणे पुलिस ने इस मामले में जांच शुरू की थी, मगर बाद में केंद्र सरकार ने इस मामले को एनआईए के हवाले कर दिया था।.